مدرسه قدیم میراز جعفر که به واسطه گذشت زمان برای محصلین علوم دینی قابل استفاده نبوده بازسازی شده است اما قسمتهای باستانی آن که جنبه هنری دارد نگهداری شده و با اضافه نمودن چندین ساختمان در اطراف آن مجموعه ای جدید بنام دانشگاه اسلامی بوجود آمده است.
این دانشگاه شامل مسجد و چندین کلاس درس به سالن اجتماعات و 250 اتاق خواب و امکانات رفاهی دیگر می باشد و صدها دانشجوی ایرانی و چندین خارجی و از جمله چینی ، پاکستانی به غرب و افغانی در ان مشغول به فراگیری علوم اسلامی می باشند. این مدرسه که در ضلع شمالی صحن عقیق و به مدرسه میرزا جعفر نامی ساخته شده و از بناهای با ارزش دوره صفویه محسوب می گردد.
آدرس :ضلع شمالی صحن عتیق
نوع بنا : تاریخی
قدمت : حدود 508 سال
( تاریخ میلادی : 1722-1501 )